Созданы:

1. 28 июня 2006 г. — Учебно-научный центр автоматизированных расчетов и проектирования химико-технологических процессов, аппаратов и систем при кафедре технологических процессов и аппаратов. Руководитель — Г. Г. Кувшинов.
2. 1 сентября 2006 г. — пост радиационного и химического наблюдения. Руководитель — И. В. Даннекер.
3. 15 сентября 2006 г. — Отдел организации торгов. Руководитель — В. Р. Мавлюкеев.
4. 19 сентября 2006 г. — Научно-учебный консультационный центр природоохранных электротехнологий. Руководитель — А. И. Алиферов.
5. 12 октября 2006 г. — Научно-консультационный центр современных технологий металлообработки и оценки качества машиностроительных материалов на базе кафедры материаловедения в машиностроении. Руководитель — Л. И. Тушинский.
6. 5 февраля 2007 г. — Информационно-правовой центр на базе ЮФ. Руководитель — Ю. П. Егоров.
7. 8 февраля 2007 г. в структуре ЮФ созданы:
— криминалистическая лаборатория;
— терминальный класс;
— лаборатория судебной экспертизы.
8. 9 апреля 2007 г. — Отдел дистанционных образовательных технологий в структуре ИДО. Руководитель — О. В. Адрюшкова.
9. 17 апреля 2007 г. — Учебно-практический центр социальных коммуникаций и PR-технологий на базе кафедры социально-массовых коммуникаций. Руководитель — В. В. Богданов.
10. 17 апреля 2007 г. — Научно-образовательный центр «Восток-Запад» на базе кафедры международных отношений и регионоведения. Руководитель — О. В. Зиневич.

Преобразованы:

1. 11 июля 2006 г. Кадровый центр преобразован в Региональный центр трудоустройства и адаптации выпускников к рынку труда. Руководитель — Л. Н. Соснина.
2. 10 октября 2006 г. Отдел
менеджмента качества выделился из НМЦ в самостоятельное подразделение. Руководитель — Л. А. Евграфова.
3. 11 октября 2006 г. Отдел инноваций преобразован в Инновационно-технологический центр. Руководитель — Е. Д. Житенко.
4. 16 ноября 2006 г. пресс-центр преобразован в Информационную службу. Руководитель — М. А. Бовтенко.
5. 16 ноября 2006 г. на базе Центра лингвометодических информационных ресурсов ИДО создана Учебно-научная лаборатория прикладной лингвистики и информационных образовательных технологий. Руководитель — М. А. Бовтенко.